Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SLC39A9Q9NUM3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SLC39A9Q9NUM3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms