Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms