Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms