Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TMEM27Q9HBJ8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TMEM27Q9HBJ8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM27Q9HBJ8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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