Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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