Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms