Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZYG11BQ9C0D3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZYG11BQ9C0D3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms