Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHACTR1Q9C0D0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms