Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms