Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms