Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COL25A1Q9BXS0 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms