Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms