Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SEC22CQ9BRL7 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SEC22CQ9BRL7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SEC22CQ9BRL7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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