Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MESP1Q9BRJ9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms