Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPIFA3Q9BQP9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms