Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CRBNQ96SW2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms