Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms