Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLIP3Q96DZ5 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms