Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms