Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOBEC4Q8WW27 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms