Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC71Q8IV32 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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