Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms