Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GDF6Q6KF10 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms