Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPPQ6IPU0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms