Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATL3Q6DD88 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms