Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF220Q5VTB9 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF220Q5VTB9 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF220Q5VTB9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF220Q5VTB9 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF220Q5VTB9 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF220Q5VTB9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF220Q5VTB9 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF220Q5VTB9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF220Q5VTB9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF220Q5VTB9 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF220Q5VTB9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF220Q5VTB9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF220Q5VTB9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF220Q5VTB9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF220Q5VTB9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF220Q5VTB9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF220Q5VTB9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF220Q5VTB9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF220Q5VTB9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF220Q5VTB9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF220Q5VTB9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF220Q5VTB9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms