Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms