Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC93Q567U6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms