Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms