Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AL359641.1-201ENST00000412509 1558 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SLC13A2-202ENST00000444914 2855 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 FCRL2-201ENST00000361516 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 UHRF1-206ENST00000622802 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 FBXO9-202ENST00000323557 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 HNRNPR-201ENST00000302271 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms