Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC38Q502W7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms