Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms