Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KHDC1Q4VXA5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KHDC1Q4VXA5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms