Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDB1Q16531 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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DDB1Q16531 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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DDB1Q16531 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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DDB1Q16531 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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DDB1Q16531 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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DDB1Q16531 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDB1Q16531 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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