Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC85BQ15834 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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