Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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