Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHBQ15464 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SHBQ15464 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SHBQ15464 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SHBQ15464 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SHBQ15464 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SHBQ15464 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SHBQ15464 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms