Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms