Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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TNIP1Q15025 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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TNIP1Q15025 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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TNIP1Q15025 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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TNIP1Q15025 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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TNIP1Q15025 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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TNIP1Q15025 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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TNIP1Q15025 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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TNIP1Q15025 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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TNIP1Q15025 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNIP1Q15025 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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