Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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GTF2H3Q13889 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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GTF2H3Q13889 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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GTF2H3Q13889 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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GTF2H3Q13889 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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GTF2H3Q13889 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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GTF2H3Q13889 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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GTF2H3Q13889 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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GTF2H3Q13889 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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GTF2H3Q13889 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF2H3Q13889 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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