Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CUL4BQ13620 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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