Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
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