Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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