Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ITGB3BPQ13352 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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ITGB3BPQ13352 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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ITGB3BPQ13352 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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ITGB3BPQ13352 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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ITGB3BPQ13352 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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ITGB3BPQ13352 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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ITGB3BPQ13352 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGB3BPQ13352 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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