Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 MDH1-203ENST00000409908 700 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.371e-12■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.055e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 ATP6V1E1-208ENST00000481365 692 ntTSL 48.54□□□□□ -1.045e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 ATP6V1E1-204ENST00000413576 800 ntTSL 35.94□□□□□ -1.465e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.171e-18■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 UBXN6-206ENST00000590466 803 ntTSL 324.21■■□□□ 1.475e-7■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 UBXN6-203ENST00000587009 1967 ntTSL 222.61■■□□□ 1.215e-7■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 UBXN6-207ENST00000591919 1613 ntTSL 520.85■□□□□ 0.935e-7■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.865e-7■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 UBXN6-205ENST00000588238 4598 nt16.87■□□□□ 0.295e-7■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 EFTUD2-217ENST00000590124 899 ntTSL 323.83■■□□□ 1.412e-10■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 EFTUD2-202ENST00000426333 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.52e-10■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 EFTUD2-223ENST00000592576 3364 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.722e-10■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 EFTUD2-219ENST00000590977 2422 ntTSL 210.33□□□□□ -0.762e-10■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 EFTUD2-205ENST00000586276 3678 ntTSL 29.61□□□□□ -0.872e-10■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 EFTUD2-218ENST00000590367 3638 ntTSL 28.59□□□□□ -1.042e-10■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.042e-10■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 31e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 NOL6-205ENST00000464829 1829 ntTSL 218.28■□□□□ 0.522e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.512e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.42e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.342e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.172e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.915e-22■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 BCAP31-206ENST00000442093 793 ntTSL 226.56■■□□□ 1.841e-8■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 BCAP31-204ENST00000429550 684 ntTSL 323.86■■□□□ 1.411e-8■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 BCAP31-202ENST00000416815 688 ntTSL 522.73■■□□□ 1.231e-8■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 BCAP31-203ENST00000423827 669 ntTSL 518.93■□□□□ 0.621e-8■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.232e-9■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.212e-9■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 SNRPC-203ENST00000374018 600 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.42e-9■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 PEBP1-202ENST00000542939 708 ntTSL 318.24■□□□□ 0.511e-11■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 PLEKHJ1-207ENST00000588356 610 ntTSL 429.15■■■□□ 2.266e-7■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 ERGIC3-209ENST00000447986 1632 ntTSL 1 (best)15.48■□□□□ 0.071e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.83e-28■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 GTPBP2-203ENST00000419497 1394 ntTSL 218.85■□□□□ 0.613e-28■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 GTPBP2-204ENST00000432918 1850 ntTSL 314.49□□□□□ -0.093e-28■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 GTPBP2-201ENST00000307114 2830 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.33e-28■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 GTPBP2-208ENST00000476510 2816 ntTSL 512.31□□□□□ -0.443e-28■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 GTPBP2-210ENST00000496137 516 ntTSL 38.01□□□□□ -1.133e-28■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.891e-7■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 TMEM147-206ENST00000595180 546 ntTSL 222.95■■□□□ 1.261e-7■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 NOL6-203ENST00000379470 2190 ntTSL 214.5□□□□□ -0.091e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 NOL6-201ENST00000297990 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)13.74□□□□□ -0.211e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 NOL6-204ENST00000379471 3843 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.571e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 NOL6-202ENST00000353159 3411 ntTSL 1 (best)11.14□□□□□ -0.631e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 RACK1-228ENST00000512968 1058 ntTSL 511.28□□□□□ -0.63e-42■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 RPL10-208ENST00000449494 622 ntTSL 517.63■□□□□ 0.412e-32■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 RPL10-205ENST00000427682 457 ntTSL 512.64□□□□□ -0.392e-32■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 RPL10-206ENST00000428169 292 ntTSL 511.79□□□□□ -0.522e-32■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 NMRAL1-206ENST00000572232 659 ntTSL 316.82■□□□□ 0.287e-8■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 NMRAL1-205ENST00000572110 456 ntTSL 514.1□□□□□ -0.157e-8■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 HK1-202ENST00000359426 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.423e-7■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 HK1-201ENST00000298649 3596 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.523e-7■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 HK1-206ENST00000448642 3868 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.683e-7■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 HK1-203ENST00000360289 3961 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.843e-7■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.162e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 TAF15-210ENST00000604694 891 ntTSL 520.75■□□□□ 0.912e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 TAF15-206ENST00000603967 656 ntTSL 320.75■□□□□ 0.912e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.82e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.432e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.172e-31■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.12e-31■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.562e-31■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 ACTG1-215ENST00000576917 1958 ntTSL 515.27■□□□□ 0.042e-31■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.012e-31■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 ACTG1-216ENST00000615544 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.072e-31■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 ACTG1-214ENST00000576544 1720 ntTSL 514.48□□□□□ -0.092e-31■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 ACTG1-212ENST00000576209 1698 ntTSL 1 (best)14.11□□□□□ -0.152e-31■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 ACTG1-207ENST00000574671 1678 ntTSL 1 (best)13.63□□□□□ -0.232e-31■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.114e-75■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.074e-75■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.044e-75■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.114e-75■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 PRAME-213ENST00000492657 2831 ntTSL 1 (best)14.24□□□□□ -0.134e-75■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 BSG-212ENST00000590218 545 ntTSL 222.82■■□□□ 1.243e-69■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 BSG-207ENST00000573216 545 ntTSL 421.06■□□□□ 0.963e-69■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 BSG-210ENST00000576925 611 ntTSL 221.06■□□□□ 0.963e-69■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 BSG-213ENST00000613627 689 ntTSL 318.62■□□□□ 0.573e-69■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 BSG-206ENST00000572899 582 ntTSL 218.44■□□□□ 0.543e-69■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 PSMC5-215ENST00000583283 602 ntTSL 423.87■■□□□ 1.412e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 PSMC5-210ENST00000581764 2107 ntTSL 520.62■□□□□ 0.892e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 PSMC5-213ENST00000582130 828 ntTSL 318.33■□□□□ 0.522e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 PSMC5-216ENST00000584320 804 ntTSL 516.64■□□□□ 0.252e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 PSMC5-220ENST00000585123 899 ntTSL 516.48■□□□□ 0.232e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 PSMC5-217ENST00000584536 804 ntTSL 515.94■□□□□ 0.142e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 PSMC5-206ENST00000579708 558 ntTSL 412.89□□□□□ -0.352e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 PSMC5-211ENST00000581842 809 ntTSL 511.98□□□□□ -0.492e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 YKT6-204ENST00000447123 1085 ntTSL 522.89■■□□□ 1.252e-7■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 YKT6-203ENST00000424864 673 ntTSL 514.08□□□□□ -0.162e-7■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.368e-10■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.938e-10■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.178e-10■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.121e-323■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TIAL1-211ENST00000489822 2222 ntTSL 218.15■□□□□ 0.52e-11■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TIAL1-213ENST00000497671 2321 ntTSL 1 (best)16.2■□□□□ 0.182e-11■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TIAL1-207ENST00000463089 907 ntTSL 58.72□□□□□ -1.012e-11■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.022e-11■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TIAL1-205ENST00000436547 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.032e-11■□□□□ 10.4
PABPC4Q13310 TIAL1-209ENST00000470781 1727 ntTSL 26.63□□□□□ -1.352e-11■□□□□ 10.4
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