Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SKP2Q13309 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SKP2Q13309 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SKP2Q13309 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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SKP2Q13309 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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SKP2Q13309 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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SKP2Q13309 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SKP2Q13309 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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