Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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CLN3Q13286 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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