Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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