Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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