Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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